PerlPrimer : Outil de conception de primers PCR
PerlPrimer est une application GUI gratuite et open-source, écrite en Perl, qui facilite la conception de primers pour divers types de PCR, y compris la PCR standard, la PCR bisulfite et la PCR en temps réel (QPCR). Son principal objectif est d'automatiser et de simplifier le processus de conception des primers, rendant cet outil essentiel pour les chercheurs en bioinformatique. Parmi ses fonctionnalités, on trouve le calcul des dimères de primers, la récupération de séquences génomiques depuis Ensembl, et la possibilité de recherche BLAST pour les primers.
L'application permet également de détecter les ORF et les îlots CpG, et de personnaliser les séquences de clonage des primers. Elle calcule la température de fusion des primers avec une grande précision grâce à des paramètres thermodynamiques avancés. PerlPrimer est compatible avec plusieurs systèmes d'exploitation, y compris Windows et GNU/Linux, et a même été signalé comme fonctionnant sur Mac OS X, ce qui le rend accessible à un large éventail d'utilisateurs.
